(آشنایی با لمپس) - کار با نرم افزار BioVEC جهت نمایش بیضی گونها و کره ها در شبیه سازی دینامیک مولکولی
این آموزش که بصورت فایل pdf و در ۶ صفحه تنظیم شده است کار با نرم افزار BioVEC در محیط ویندوز را شرح داده است. شما می توانید نتایج شبیه سازیهای دینامیک مولکولی ذرات دیسک گونه - ذرات کروی - ذرات بیضی گون را نمایش دهید. نتایج شبیه سازیهایی نظیر کریستالهای مایع و درشت دانه نیز قابل نمایش است. پیوند بین ذرات در صورت وجود را نمایش داده و می توان ذرات با قطرهای مختلف را با رنگهای مختلف به نمایش درآورد. این آموزش به همراه فایلهای مرتبط با یک مثال برای دانلود قرار داده شده است. تاریخ انتشار: ۶ فروردین 1395
(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی غشای سلولی با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی
(آموزش lammps) در این آموزش سعی شده است به روش ساده و گام به گام غشای سلولی را به روش دینامیک مولکولی شبیه سازی کرده و آن را اجرا کنیم. نرم افزار مورد استفاده لمپس (LAMMPS) می باشد. فایلهای مورد نیاز همراه آموزش قرار داده شده اند. طول فیلم ۱۶ دقیقه و حجم آم ۱۴۰ مگابایت و به فرمت mp4 است. آموزش در محیط لینوکس ubuntu می باشد. تاریخ انتشار ۱۴ فروردین ۱۳۹۵
(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی سه مدل آب TIP3P , TIP4P , SPC با استفاده از نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی
(آموزش lammps) در این آموزش شما یاد خواهید گرفت چگونه آب را با مدل هایی که لمپس (LAMMPS) پشتیبانی می کند شبیه سازی کنید. شبیه سازی سیستم های زیستی نیازمند داشتن مهارت شبیه سازی مولکول آب است چرا که در این سیستمها همیشه مولکول آب وجود دارد. بیش از ۲۵ مدل آب وجود دارد که تنها ۳ مدل TIP3P , TIP4P , SPC در لمپس پشتیبانی می شوند. به ساده ترین روش و بصورت گام به گام این مدل ها توضیح داده می شوند. تمامی فایلها و برنامه های لمپس همراه آموزش تقدیم خواهد شد. کیفیت فیلم HD و مت زمان آموزش یک ساعت است.آموزش توی محیط لینوکس ubuntu می باشد. تاریخ انتشار ۱ اردیبهشت ۹۵